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- Portail Emploi CNRS - Offre d'emploi - Post-doctorat en Neuroscience et Machine Learning (H/F)
Post-doctorat en Neuroscience et Machine Learning (H/F)
Nouveau
Développement, Adaptation, Vieillissement
PARIS 05
- Paris
- Chercheur en contrat CDD
- 18 mois
- Doctorat
This offer is available in English version
Cette offre est ouverte aux personnes disposant d’un titre leur reconnaissant la qualité de travailleur handicapé ou travailleuse handicapée.
L'offre en un coup d'oeil
L'unité
Développement, Adaptation, Vieillissement
Type de Contrat
Chercheur en contrat CDD
Temps de Travail
Complet
Lieu de Travail
75252 PARIS 05
Durée du contrat
18 mois
Date d'Embauche
02/11/2026
Rémuneration
La rémunération est de 3200– 4000 € brut/mois selon l'expérience
Postuler Date limite de candidature : mardi 15 septembre 2026 23:59
Description du Poste
Les Missions
Vous rejoindrez une équipe interdisciplinaire au CNRS pour travailler sur un projet innovant visant à :
- Construire une base de données précliniques à partir de modèles murins (souris/rats) pour étudier l’impact de la stimulation neuromusculaire respiratoire.
- Développer des modèles prédictifs (apprentissage supervisé/non supervisé, deep learning) pour identifier les répondeurs/non-répondeurs et optimiser les programmes de stimulation.
- Valider les modèles via des protocoles expérimentaux sur animaux, en combinant biologie, traitement du signal et data science.
L'Activité
Le projet s’articule autour de deux axes principaux :
- Expérimentation animale : Acquisition de données physiologiques (EMG, respiration, SpO2, etc.) sur modèles murins.
- Modélisation prédictive : Développement de méthodes avancées de ML pour analyser ces données et proposer des programmes de stimulation optimaux.
Missions principales
- Expérimentation animale (30 à 40% du temps)
- Conception et mise en œuvre de protocoles sur modèles murins :
- Mesures à J0, J2, J3, J15 : poids, paramètres respiratoires (Vt, Fr, Ti, Te), EMG (diaphragme/intercostaux/abdominaux), SpO2, indice de masse maigre, variabilité respiratoire.
- Respect des bonnes pratiques (éthique, réglementation sur l’expérimentation animale).
- Acquisition et prétraitement des données :
- Nettoyage, structuration et annotation des données pour les rendre exploitables en ML.
- Automatisation des pipelines de collecte (scripts Python).
- Modélisation prédictive (60à 70% du temps)
- Développement de modèles d’apprentissage supervisé et non supervisé :
- Classification (SVM, Random Forest, KNN) pour prédire la réponse à la stimulation.
- Régression pour estimer l’efficacité des programmes de stimulation.
- Application de méthodes d’apprentissage profond :
- Utilisation de réseaux de neurones (CNN, éventuellement RNN/Transformers) pour analyser des signaux biologiques (EMG, respiration).
- Intégration de la multimodalité (combinaison de données numériques et de signaux bruts).
- Traitement statistique et modélisation des données biologiques :
- Analyse de la variabilité des signaux (ECG, EEG, EMG).
- Sélection de features pertinentes et interprétabilité des modèles (SHAP, LIME).
- Validation des modèles :
- Évaluation des performances (AUC-ROC, précision/rappel, RMSE).
Votre Profil
Compétences
🔹 Compétences obligatoires en neuroscience et modélisation
- Expérience dans le développement de méthodes d’apprentissage supervisé et non supervisé :
- Maîtrise des algorithmes de classification (SVM, Random Forest, KNN) et de régression.
- Expérience en sélection de features et validation de modèles.
- Connaissance des méthodes d’apprentissage profond :
- Expérience avec les CNN (pour l’analyse de signaux) et éventuellement d’autres architectures (RNN, Transformers).
- Capacité à adapter ces méthodes à des données biologiques complexes.
- Connaissance des données de biologie en théorie du signal :
- Expérience avec des signaux physiologiques (ECG, EEG et/ou EMG) : acquisition, prétraitement, extraction de features.
- Compréhension des enjeux spécifiques liés à l’analyse de ces signaux (bruit, artefacts, variabilité inter-individuelle).
- Connaissances en traitement statistique et modélisation des données biologiques :
- Maîtrise des tests statistiques (ANOVA, régression, tests non paramétriques).
- Expérience en modélisation prédictive appliquée à la biologie ou à la médecine.
🔹 Compétences obligatoires en expérimentation animale
- Expérience avérée en manipulation de modèles murins (souris/rats) avec notamment :
- Evaluation fonctionnelle
- Et/ou Experience en chirurgie
- Et/ou Maîtrise des techniques d’acquisition de données physiologiques (EMG, respiration, SpO2).
- Respect des normes éthiques et réglementaires liées à l’expérimentation animale.
🔹 Compétences en développement informatique
- Expérience confirmée en Python :
- Maîtrise des librairies : scikit-learn, tensorflow/pytorch, pandas, numpy, matplotlib/seaborn.
- Capacité à développer des scripts robustes pour le prétraitement, l’analyse et la modélisation.
- Utilisation d’outils collaboratifs :
- Git (gestion de version), Jupyter Notebooks, environnements de développement (VS Code, etc.).
Votre Environnement de Travail
Equipe NeAR, environement: 9 chercheurs PI, 5 doctorants, 3 Ingénieurs d'étude; groupe spécifique sur la respiration composé de 3 doctorants et un IE. Partage des zones expérimentales, travail en équipe valorisé, réunions de travail hebdomadaire, séminaires de labo et/ou d'unité hebdomadaires
Contraintes et risques
Le poste implique des risques liés à l’expérimentation animale (manipulation de modèles murins, injections, prélèvements) ainsi qu’à l’utilisation de produits chimiques pour l’immunohistochimie et la biochimie (réactifs, colorants, solvants). Le/la candidat(e) devra respecter les protocoles de sécurité en vigueur (port d’équipements de protection individuelle, manipulation sous hotte à flux laminaire si nécessaire) et se conformer aux règlementations en matière d’éthique animale et de gestion des déchets chimiques. Une formation aux bonnes pratiques de laboratoire sera dispensée à l’arrivée.
Rémunération et avantages
Rémunération
La rémunération est de 3200– 4000 € brut/mois selon l'expérience
Congés et RTT annuels
44 jours
Pratique et Indemnisation du TT
Pratique et indemnisation du TT
Transport
Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€
À propos de l’offre
Référence de l’offre UMR8263-ISAVIV-009 Section(s) CN / Domaine de recherche Neurobiologie moléculaire et cellulaire, neurophysiologie
À propos du CNRS
Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.
Le CNRS
Les métiers de la recherche
Publiée il y a 0 heure(s)
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